Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	146589	146603	15	5 [0]	[0] 52	ligT	2'‑5' RNA ligase

TTTCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGG  >  minE/146604‑146656 |                                                     tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:786001/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:607545/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:613388/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:638688/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:644785/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:648644/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:670857/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:680444/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:683179/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:686080/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:744832/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:771207/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:772827/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:580858/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:79372/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:79818/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:82018/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:8215/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:829950/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:860714/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:932741/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:94695/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:960418/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:962361/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:965748/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:969167/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:174380/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1013583/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1014138/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1016600/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1034331/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1036290/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:108389/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:131566/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:135088/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:138154/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:141188/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:144694/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:173476/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:1005594/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:275679/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:296218/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:30159/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:364432/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:379551/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:382372/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:382383/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:434307/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:439126/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:489680/53‑1 (MQ=255) tttCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:540632/53‑1 (MQ=255) tttCTAGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATcgg  <  1:407892/53‑1 (MQ=255) |                                                     TTTCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGG  >  minE/146604‑146656

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑