Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1827652	1827999	348	88 [0]	[0] 52	mutS	methyl‑directed mismatch repair protein

CCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGA  >  minE/1828000‑1828061 |                                                              ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCt                     >  1:108630/1‑43 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATg   >  1:427827/1‑61 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATg   >  1:238864/1‑61 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:801964/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:669265/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:686288/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:692337/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:69888/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:700667/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:732346/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:751124/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:752224/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:756092/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:760139/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:784342/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:784926/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:555543/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:803964/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:826319/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:830920/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:876827/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:883381/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:895132/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:936065/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:949375/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:977815/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:987964/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:998033/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:327883/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:1017409/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:1033892/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:126408/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:138869/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:157673/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:197555/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:24488/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:257762/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:25953/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:284546/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:326439/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:587724/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:37159/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:383102/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:385118/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:38867/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:391563/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:39487/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:398885/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:492418/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:527321/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:1008760/1‑62 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATAGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGa  >  1:413632/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGA  >  minE/1828000‑1828061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑