Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1840526	1840600	75	87 [0]	[0] 47	truD	pseudoruidine synthase

TAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAGG  >  minE/1840601‑1840662 |                                                              tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGATAgg  <  1:349634/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:806283/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:636405/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:648385/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:650683/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:665560/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:693170/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:741834/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:764118/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:78012/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:787292/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:788506/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:59408/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:807874/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:813900/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:815761/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:859262/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:867021/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:879764/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:884743/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:922578/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:93842/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:944890/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:960993/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:279118/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:1010260/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:110319/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:121278/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:136204/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:138821/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:209211/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:21850/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:23755/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:256299/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:271280/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:612090/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:392267/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:395371/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:503135/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:574513/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:575341/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:578537/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:580074/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:580910/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:1006031/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGCTGAAAgg  <  1:284559/62‑1 (MQ=255) tAAACGCAGCTTGCGCTTGTGACGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAgg  <  1:169921/62‑1 (MQ=255) |                                                              TAAACGCAGCTTGCGCTTGTGCCGCGCATACTCCAGCACCTGGCAGCCTTCCAGTTGAAAGG  >  minE/1840601‑1840662

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑