Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1938807	1938975	169	80 [0]	[0] 19	xerD	site‑specific tyrosine recombinase

AAGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTG  >  minE/1938976‑1939037 |                                                              aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCATTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:73286/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGccc                    >  1:334670/1‑44 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATg              >  1:951267/1‑50 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCTCTCAttt   >  1:817371/1‑61 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCAttt   >  1:785493/1‑61 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCAttt   >  1:30227/1‑61 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:620304/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:934062/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:831524/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:743388/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:648353/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:1000918/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:606842/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:290171/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:214116/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:213441/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:15221/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:106188/1‑62 (MQ=255) aaGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGAGCCCCTTATGGTCACTCATTTg  >  1:834003/1‑62 (MQ=255) |                                                              AAGAAACTGCTCGATGCGTGCCAGATCCTGTTTCACTTGCGCCCCTTATGGTCACTCATTTG  >  minE/1938976‑1939037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑