Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	161047	161352	306	4 [0]	[0] 80	[degP]–[cdaR]	[degP],[cdaR]

CGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATC  >  minE/161353‑161395 |                                           cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:612318/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:713636/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:705398/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:694360/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:686346/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:664284/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:638862/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:636961/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:633348/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:619095/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:714773/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:596653/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:593391/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:577686/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:577620/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:573236/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:562570/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:54492/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:544086/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:53635/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:878629/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:99032/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:989616/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:965503/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:932060/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:919431/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:908159/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:899670/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:895770/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:894512/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:51916/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:872060/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:857604/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:787655/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:776149/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:770707/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:741492/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:739392/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:736442/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:725230/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:202444/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:25878/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:254307/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:254153/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:243181/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:231885/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:22571/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:225017/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:223972/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:206662/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:277886/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:171131/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:167059/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:166159/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:142190/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:13587/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:119188/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:10707/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:1036099/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:1033457/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:389763/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:501245/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:456143/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:44303/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:435416/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:433345/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:432157/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:429262/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:422497/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:1026611/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:378372/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:373322/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:357817/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:344130/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:321338/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:320509/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:308750/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:301702/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATc  <  1:283803/43‑1 (MQ=255) cGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGAGGGCGAATTATc  <  1:437204/43‑1 (MQ=255) |                                           CGATACCAATATCAACGTAATGGATGCCCGTGGGCGAATTATC  >  minE/161353‑161395

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑