Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	161396	161556	161	82 [0]	[0] 87	cdaR	DNA‑binding transcriptional regulator

CGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGA  >  minE/161557‑161618 |                                                              cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGt                           >  1:645901/1‑37 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaa                         >  1:596707/1‑39 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAatat                     >  1:237055/1‑43 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATg                    >  1:968435/1‑44 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTgg           >  1:124722/1‑53 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTgg           >  1:646837/1‑53 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTgg           >  1:432978/1‑53 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGc      >  1:134778/1‑58 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:619444/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:716471/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:716413/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:695148/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:650567/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:645284/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:643911/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:640835/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:634940/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:630694/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:747438/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:602684/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:601201/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:582660/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:569545/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:563055/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:562147/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:897650/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:994953/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:985886/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:97701/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:959370/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:94025/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:935846/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:93313/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:920552/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:91004/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:717860/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:877663/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:869721/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:851855/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:83794/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:831625/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:787298/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:74875/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:528717/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:736082/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:272400/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:561043/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:34788/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:340367/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:333074/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:325992/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:31964/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:309309/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:297433/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:292342/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:289772/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:357601/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:271574/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:258553/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:256741/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:24960/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:21664/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:180508/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:179260/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:140947/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:118825/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:454298/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:537877/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:1000791/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:524331/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:523436/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:506097/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:48778/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:480138/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:474223/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:46880/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:463579/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:363129/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:449179/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:445862/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:442290/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:431097/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:422639/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:406332/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:394176/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:387997/1‑62 (MQ=255) cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCCGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGa  >  1:745900/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAATATGGCGAACTGGTCTGCATGA  >  minE/161557‑161618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑