Missing coverage evidence...
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TATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGT  >  minE/1966356‑1966417 |                                                              tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTTACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:380902/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGTAAACCGgt  >  1:896184/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:691935/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:52817/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:563082/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:575278/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:59452/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:668903/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:677213/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:688089/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:485202/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:712751/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:788023/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:797182/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:872688/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:893931/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:981094/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:1011216/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:470305/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:462955/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:429620/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:427562/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:41515/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:386218/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:324493/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:309856/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:30947/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:270350/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:220403/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:2178/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:180194/1‑62 (MQ=255) tataGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGgt  >  1:140676/1‑62 (MQ=255) |                                                              TATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGT  >  minE/1966356‑1966417

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑