Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1989911	1990230	320	40 [0]	[0] 61	[mutY]	[mutY]

CTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAG  >  minE/1990231‑1990292 |                                                              cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:793092/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:535921/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:573661/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:577948/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:588797/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:589213/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:599433/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:607026/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:62233/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:690739/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:729448/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:732857/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:736576/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:73971/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:756398/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:517703/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:814006/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:831867/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:835380/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:863253/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:873323/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:880810/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:888019/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:890727/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:91178/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:92443/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:924690/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:9498/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:961381/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:978691/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:293885/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:1014038/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:1020636/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:1026115/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:11303/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:122045/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:134535/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:204016/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:213916/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:225850/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:244065/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:244146/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:272546/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:1002911/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:391163/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:50448/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:470319/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:467657/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:446710/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:440385/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:421179/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:411516/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:302650/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:377644/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:357987/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:334998/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:320143/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:309272/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTCCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:809056/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATATGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:255566/62‑1 (MQ=255) cTTATGGACCGCGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAg  <  1:1032432/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTTATGGACCGGGCTTGGCTATTACGCCCGCGCGCGCAATCTGCATAAAGCGGCACAACAAG  >  minE/1990231‑1990292

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑