Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	166483	166695	213	30 [0]	[0] 53	glnD	uridylyltransferase

CGCCCGCTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCA  >  minE/166696‑166742 |                                               cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGa              >  1:127630/1‑35 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGAcc            >  1:263925/1‑37 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGAGCATTTCATCCa  >  1:462620/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTc       >  1:247644/1‑42 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCGTCCa  >  1:26624/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATcc   >  1:465179/1‑46 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:569626/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:719588/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:717463/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:630782/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:592759/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:59111/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:518913/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:566739/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:558429/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:549275/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:997996/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:721447/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:728085/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:765421/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:771955/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:79612/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:797374/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:80814/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:879939/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:88607/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:938860/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:942475/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:96799/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:1005680/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:229055/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:1008892/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:1025116/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:1038205/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:106422/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:140738/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:14500/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:154012/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:18967/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:19697/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:225299/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:227486/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:493954/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:277769/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:312296/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:316677/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:318987/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:335147/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:343753/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:403585/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:408483/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:438033/1‑47 (MQ=255) cgcccgcTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCa  >  1:48108/1‑47 (MQ=255) |                                               CGCCCGCTCCGCTGAGGTTAAGAAGCCAAACCCGACCATTTCATCCA  >  minE/166696‑166742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑