Missing coverage evidence...
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CATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGA  >  minE/2026979‑2027039 |                                                             cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGTCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:723671/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCtaa  <  1:731537/61‑3 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:59822/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:995630/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:972853/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:965377/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:906238/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:890010/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:885036/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:79641/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:736027/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:614155/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:1011198/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:550973/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:397511/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:365779/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:356452/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:348075/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:330352/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:266321/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:250944/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:246935/61‑1 (MQ=255) cATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGa  <  1:1031572/61‑1 (MQ=255) |                                                             CATATGGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGA  >  minE/2026979‑2027039

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑