Missing coverage evidence...
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AAAAAAGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTC  >  minE/169751‑169812  |                                                             aaaaaaG‑ACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:338409/61‑1 (MQ=255)  aaataGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:1027909/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:524668/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:996958/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:98739/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:959128/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:907297/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:901029/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:857356/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:853874/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:770417/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:689439/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:665695/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:63609/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:511537/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:478858/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:472560/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:468104/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:438694/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:369964/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:333573/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:328121/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:307837/61‑1 (MQ=255)  aaaaaGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTc  <  1:124000/61‑1 (MQ=255)  |                                                             AAAAAAGCACTGACTGAAGCTAACGGCGACATCGAGCTGGCAATCGAAAACATGCGTAAGTC  >  minE/169751‑169812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑