Missing coverage evidence...
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GGTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGA  >  minE/2079356‑2079417 |                                                              ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:792356/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:547410/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:551827/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:569453/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:627429/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:63930/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:653137/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:741676/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:752960/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:76195/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:77673/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:777406/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:535249/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:827650/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:86012/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:862445/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:876267/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:887779/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:913049/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:914845/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:927933/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:945129/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:960867/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:290245/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:108346/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:162330/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:174285/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:175771/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:182333/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:205717/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:206027/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:232755/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:266573/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:275244/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:281417/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:1008413/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:308386/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:338411/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:359719/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:428208/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:434523/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:480196/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:50239/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:511034/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:533036/62‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTACGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGa  <  1:340766/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGTCGCCTGTTCGATGTTGAAGGCTTTGTCCGGACGCCAGCTCGGCAGCACTTTGATGGTGA  >  minE/2079356‑2079417

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑