Missing coverage evidence...
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CGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGC  >  minE/2084607‑2084654 |                                                cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:557267/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:978517/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:966149/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:888899/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:864164/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:863994/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:801321/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:801182/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:79111/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:724009/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:704108/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:657752/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:654837/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:653706/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:578041/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:100499/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:50980/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:503977/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:502585/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:473948/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:465927/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:465902/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:42388/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:401396/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:31746/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:297659/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:268535/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:258985/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:197980/48‑1 (MQ=255) cGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGc  <  1:148641/48‑1 (MQ=255) |                                                CGTGCTGAGTTGAAATCCCTTTCCGATACGCTGGAAGAGGTGCTTAGC  >  minE/2084607‑2084654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑