Missing coverage evidence...
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CTCTGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTGG  >  minE/2123367‑2123423 |                                                         ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:735928/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:647351/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:649791/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:660376/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:661458/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:669862/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:671095/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:704421/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:71706/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:608531/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:755535/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:776977/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:796802/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:816210/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:831780/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:835172/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:83531/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:47812/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:148789/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:16223/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:165613/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:238225/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:274992/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:351094/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:470902/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:1019159/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:4932/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:527307/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:544052/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:565014/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:580237/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:583846/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTgg  <  1:592701/57‑1 (MQ=255) ctctGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGAATTCCAGTTACCTgg  <  1:334251/57‑1 (MQ=255) |                                                         CTCTGCCAGCATGACCCGCGCCACGTCTCTCGCATCAATGGATTTCCAGTTACCTGG  >  minE/2123367‑2123423

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑