Missing coverage evidence...
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AAAAATTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCAGA  >  minE/2157157‑2157217 |                                                             aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTgcg                         >  1:88115/1‑38 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCcga  >  1:430231/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:738524/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:54971/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:613986/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:638257/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:643559/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:652156/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:729580/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:73021/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:101462/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:774926/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:796050/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:822396/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:829652/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:881936/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:999827/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:307737/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:100123/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:1023011/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:121938/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:150186/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:169601/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:253821/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:267015/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:303133/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:534056/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:383762/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:41720/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:441932/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:469256/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCaga  >  1:49574/1‑61 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCag   >  1:654985/1‑60 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCag   >  1:812030/1‑60 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCag   >  1:571862/1‑60 (MQ=255) aaaaaTTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTAGCCaga  >  1:676217/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAAAATTAAACATGCGAGCTGCCAGTGGCTAAGCTGCGCTATCACTCCAGGCTTTGCCAGA  >  minE/2157157‑2157217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑