Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2158216	2158414	199	26 [0]	[0] 31	[rplU]	[rplU]

CGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCTTT  >  minE/2158415‑2158476 |                                                              cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACa                             >  1:630978/1‑35 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:646389/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:993392/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:992273/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:967282/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:956805/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:939260/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:878965/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:859384/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:845101/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:833105/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:805447/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:801207/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:796719/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:700364/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:666022/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:115917/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:637900/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:565886/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:548945/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:456240/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:345625/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:28518/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:284371/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:254296/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:231878/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:208835/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCttt  >  1:142738/1‑62 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCtt   >  1:671442/1‑61 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCtt   >  1:39451/1‑61 (MQ=255) cGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCtt   >  1:16587/1‑61 (MQ=255) |                                                              CGTTTGCGATCATCAGCACTTCAGCGAACTCAACAGTTTCGCCAGTTGCGATGTCCAGCTTT  >  minE/2158415‑2158476

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑