Missing coverage evidence...
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GTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAT  >  minE/2179787‑2179847 |                                                             gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACTATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:199097/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:847802/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:627097/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:640974/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:661151/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:682413/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:684434/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:713463/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:713941/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:77388/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:775658/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:783488/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:793050/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:833055/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:575056/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:848744/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:852526/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:887153/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:90124/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:925885/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:944991/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:948317/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:948766/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:962112/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:967737/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:985547/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:330336/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:1010781/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:126786/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:144742/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:14816/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:173416/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:17949/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:207353/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:261125/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:270888/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:297934/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:32628/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:326306/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:5807/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:354188/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:401743/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:429533/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:45338/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:466319/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:474498/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:483324/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:535720/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:542179/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:1000800/61‑1 (MQ=255) gTTCCCGCAGAGCCTGGGGGACGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAt  <  1:461639/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTTCCCGCAGAGCCTGGGGGAGGTTCACGATATGTTGTACGATAAATCCCTTGAGAGGGAT  >  minE/2179787‑2179847

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑