Missing coverage evidence...
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CGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCG  >  minE/2189006‑2189067 |                                                              cGAAATCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:381155/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCGGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:339555/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCTGCTTCg  <  1:54107/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:823340/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:662919/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:663368/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:683943/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:692021/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:693219/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:789712/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:793925/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:816898/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:605390/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:839985/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:876082/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:880114/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:904858/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:917969/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:932336/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:945659/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:97473/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:992519/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:362793/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:131548/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:136637/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:137965/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:14862/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:223438/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:234987/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:253906/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:305063/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:617843/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:38100/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:383958/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:407746/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:42469/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:472955/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:548824/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:577870/62‑1 (MQ=255) cGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCg  <  1:1005494/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGAAAGCGTGCCAGGTAGCAGAGACGCTGTTGAGATGCGATTGCAACGCACGATCGGCTTCG  >  minE/2189006‑2189067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑