Missing coverage evidence...
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GATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTG  >  minE/2203538‑2203598 |                                                             gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTATCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:876426/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:747705/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:493301/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:505419/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:587084/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:604996/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:65353/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:673153/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:698991/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:702176/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:492806/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:768040/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:791036/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:923126/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:935625/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:941813/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:947832/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:955941/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:276080/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:1030099/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:107646/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:114159/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:12078/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:129011/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:137342/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:201768/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:231814/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:1004290/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:277261/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:316355/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:370118/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:383974/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:396771/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:441691/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:474365/61‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTg  <  1:491769/61‑1 (MQ=255) |                                                             GATCTTGTTTGCCAGTGACCACCACTGTAGCAGTGGTGCCCGCAGGCCAGATGTTCTCTTG  >  minE/2203538‑2203598

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑