Missing coverage evidence...
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CAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACA  >  minE/2267294‑2267355 |                                                              cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:752094/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:577096/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:577130/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:609608/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:663962/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:671489/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:684696/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:69443/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:707402/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:710744/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:739995/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:748043/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:560681/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:757567/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:810469/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:822951/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:85166/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:856866/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:859052/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:930852/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:934847/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:944763/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:976146/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:980672/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:343088/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:1013500/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:110672/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:127287/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:131988/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:136700/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:193429/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:22457/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:236905/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:284157/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:313564/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:332403/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:1002258/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:352425/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:388134/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:419276/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:4334/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:445609/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:480428/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:504483/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:512523/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:531490/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:539151/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:542409/62‑1 (MQ=255) cAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAACATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACa  <  1:77574/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGAACTGTGACGCGCCATGGCAAATATCGCTTTGCCGATAGAGCTATGACCGCCAGAAACA  >  minE/2267294‑2267355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑