Missing coverage evidence...
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CAAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCA  >  minE/2284739‑2284798 |                                                            caAACCCCGCTTCGCCTGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:327617/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAATTCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:229210/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGTCAGATGCa  <  1:558172/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:834991/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:592787/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:613753/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:62421/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:634425/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:673297/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:69203/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:794224/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:814122/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:478791/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:854156/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:860123/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:916715/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:936942/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:943355/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:948899/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:986791/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:356210/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:172164/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:181997/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:184824/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:191832/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:215519/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:218104/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:321904/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:328167/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:529667/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:37745/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:384192/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:426726/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:442431/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:452673/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:458766/60‑1 (MQ=255) caAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCa  <  1:15961/60‑1 (MQ=255) |                                                            CAAACCCCGCTTCGCCGGTGTTAAAGAAAATCAGATCTTCAGCAAAACGCGACAGATGCA  >  minE/2284739‑2284798

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑