Missing coverage evidence...
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CAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATCG  >  minE/2296670‑2296704 |                                   cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:814478/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:587692/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:595802/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:602509/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:618233/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:642798/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:649036/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:700046/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:706429/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:722429/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:810043/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:54029/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:833506/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:84916/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:875471/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:880254/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:90763/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:925653/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:953147/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:980413/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:981639/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:326604/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:1037225/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:140748/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:145373/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:174630/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:246275/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:248748/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:253805/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:313207/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:314449/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:1034647/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:330788/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:331033/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:352642/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:364507/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:41636/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:41800/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:420823/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:456538/35‑1 (MQ=255) cAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATcg  <  1:486007/35‑1 (MQ=255) |                                   CAGCTCACTAACAGACAGACCAGAATCCGCAATCG  >  minE/2296670‑2296704

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑