Missing coverage evidence...
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CTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGCC  >  minE/2302672‑2302733 |                                                              cTAATGCCAGCGTATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:886999/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTa                    >  1:199542/1‑44 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTAt                   >  1:98820/1‑45 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATcc                 >  1:356679/1‑47 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATc                  >  1:485792/1‑46 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCCCGCTCACCGc   >  1:880076/1‑61 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:585069/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:559323/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:623090/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:653770/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:679304/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:688819/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:70568/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:744941/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:749961/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:795277/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:880890/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:881074/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:88286/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:921404/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:922719/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:926545/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:929837/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:975783/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:979437/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:1002010/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:161876/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:165122/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:180908/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:20180/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:213404/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:214021/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:229092/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:254340/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:283287/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:300115/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:313720/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:374004/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:386820/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:394949/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:3980/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:45142/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:477894/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGcc  >  1:568056/1‑62 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGca  >  1:225179/1‑61 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGc   >  1:814354/1‑61 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGc   >  1:249454/1‑61 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGc   >  1:743943/1‑61 (MQ=255) cTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGc   >  1:130145/1‑61 (MQ=255) |                                                              CTAATGCCAGCGGATTTTGTAATGCCGGGCTTAAGAAGGTGTTATCCACCACGCTCACCGCC  >  minE/2302672‑2302733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑