Missing coverage evidence...
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AACAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATTGTG  >  minE/2306950‑2307011 |                                                              aaCAGGCGCTGTCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:299061/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGTACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:599137/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:515676/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:999446/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:959326/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:956506/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:907092/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:875196/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:865912/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:853207/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:830901/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:580186/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:577110/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:525443/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:524244/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:1019530/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:461831/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:43126/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:340235/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:330952/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:203893/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:196115/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:190828/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:142443/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:114884/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:114598/62‑1 (MQ=255) aaCAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATtgtg  <  1:112545/62‑1 (MQ=255) |                                                              AACAGGCGCTGGCTGAGCGGCGAATGATGCAGCTACCGCCGTGGACCAGCCATGTGATTGTG  >  minE/2306950‑2307011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑