Missing coverage evidence...
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GGCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAGG  >  minE/198182‑198243 |                                                              ggCGCGGTTGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:723478/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:845861/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:658781/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:682335/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:69387/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:709344/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:713441/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:767251/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:778491/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:822609/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:635737/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:868124/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:873320/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:886483/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:897513/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:913544/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:940018/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:962347/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:967738/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:969063/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:417090/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:124448/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:149658/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:157205/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:163367/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:175099/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:213373/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:313081/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:342606/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:405556/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:1023610/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:437748/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:473950/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:510966/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:527933/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:533826/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:562077/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:616518/62‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAgg  <  1:623248/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCGCGGTGGACGCACAGTCGGACGCCAGCCGCCTTCCATCGTTTGATGAAAGACGAAAAGG  >  minE/198182‑198243

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑