Missing coverage evidence...
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GACGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGT  >  minE/2321435‑2321497  |                                                              gACGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATg   <  1:650857/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGTAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTACTGATGt  <  1:341461/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGGAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:1017259/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCTCCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:635214/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:546059/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:999595/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:549595/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:600940/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:601808/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:605896/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:644052/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:646412/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:654225/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:654593/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:724264/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:757415/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:764172/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:824198/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:827072/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:845457/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:900304/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:948995/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:989284/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:1009976/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:307353/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:126485/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:145578/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:15796/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:182513/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:191387/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:255913/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:268093/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:275376/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:29490/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:491025/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:313148/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:349027/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:35537/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:360938/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:364857/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:410251/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:431402/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:436292/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:448567/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:44952/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCCAGGTATTCATGACCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGt  <  1:821201/62‑1 (MQ=255)  |                                                              GACGCGCCAGGTATTCATGCCCGCGCAAACCACCTGGCAGTGGCAACCAGCGGCTGCTGATGT  >  minE/2321435‑2321497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑