Missing coverage evidence...
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CATAACTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTCC  >  minE/2331692‑2331741     |                                              tatatCTGGCACGACTGGAAACCAGTAGCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:768013/49‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTAGCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:147462/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTccc  <  1:757038/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:808194/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:648236/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:677291/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:695516/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:699551/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:704598/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:706659/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:708493/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:732576/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:740767/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:741688/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:78332/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:595249/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:829683/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:83409/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:844272/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:866186/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:8703/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:923552/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:939142/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:947399/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:967872/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:971507/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:987030/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:356868/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:1050/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:109169/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:210757/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:229672/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:230847/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:235077/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:267773/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:275265/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:275988/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:308947/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:309088/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:330670/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:596040/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:429233/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:439716/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:44343/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:452260/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:543049/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:558321/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:564785/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:570670/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:590170/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:590897/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:594369/46‑1 (MQ=255)     aCTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTcc  <  1:1037989/46‑1 (MQ=255)     |                                              CATAACTGGCACGACTGGAAACCAGTACCGCACCTTGCTGCCAGCTTTCC  >  minE/2331692‑2331741

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑