Missing coverage evidence...
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AAAATAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAGTG  >  minE/2337282‑2337343 |                                                              aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTTCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:805468/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:739859/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:562300/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:564532/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:609768/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:664352/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:667816/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:712240/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:723653/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:724876/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:522039/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:754854/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:757042/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:772865/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:809017/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:955927/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:995418/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:111830/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:501368/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:483017/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:434747/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:409545/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:388651/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:387345/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:370908/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:344840/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:333154/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:315060/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:295676/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:26146/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:184971/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:130368/62‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAgtg  <  1:126089/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAAATAATCCTCTGGGTGATTACCTGCGCTTTGCTGCGCTTATCGCCCACGCCCAGGAAGTG  >  minE/2337282‑2337343

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑