Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342248	2342271	24	53 [0]	[0] 27	glnA/glnL	glutamine synthetase/sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TTATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTATT  >  minE/2342272‑2342333 |                                                              ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:591119/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:985011/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:914086/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:897514/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:894076/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:876752/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:876329/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:868644/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:86813/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:851530/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:772019/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:754093/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:697234/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:636796/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:1034091/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:551988/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:528431/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:488649/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:483178/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:418537/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:317686/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:28281/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:233316/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:210123/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:151770/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:110742/62‑1 (MQ=255) ttATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTAtt  <  1:10962/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTATGGCAACAGGCACGCAGCCCGATGCTGGGCAGATCCTCAACTCGCTGATTAACAGTATT  >  minE/2342272‑2342333

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑