Missing coverage evidence...
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GTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGT  >  minE/201106‑201166 |                                                             gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:782778/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:657365/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:669159/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:669214/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:68180/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:693896/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:699730/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:706695/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:709268/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:722639/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:726623/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:775291/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:620626/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:817943/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:830496/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:863350/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:883451/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:888280/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:898688/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:918506/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:927693/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:965874/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:990197/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:994513/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:37312/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:110809/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:120912/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:134196/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:141414/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:189732/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:207828/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:244270/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:297070/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:34047/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:344591/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:368819/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:1016385/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:373375/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:379535/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:380215/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:398282/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:429750/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:434768/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:437453/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:475770/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:541900/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:566280/61‑1 (MQ=255) gTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGt  <  1:616533/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTCACGCGACGTTTGACCTCGTCTTTCGGTGTGTTGTCCAGCTCCAGCGGCAGAGCCACGT  >  minE/201106‑201166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑