Missing coverage evidence...
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TGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCA  >  minE/2352201‑2352247 |                                               tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:118203/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:984593/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:954436/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:920458/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:863548/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:807558/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:785670/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:768583/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:712825/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:575587/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:567856/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:511499/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:464089/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:418304/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:41528/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:409195/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:364108/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:325102/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:320709/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:234655/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:208029/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:138094/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:1027076/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCAACTGAACCca  <  1:503745/47‑1 (MQ=255) tgTATTGCTGGTGTGAAGGGCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCca  <  1:967861/47‑1 (MQ=255) |                                               TGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCA  >  minE/2352201‑2352247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑