Missing coverage evidence...
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GCACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTC  >  minE/2365943‑2366004 |                                                              gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:857775/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:582459/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:609026/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:665750/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:721602/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:737894/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:768759/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:772844/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:809689/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:834445/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:525563/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:871077/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:877677/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:895145/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:91974/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:926661/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:931427/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:944094/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:960225/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:973045/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:367729/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:1023058/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:1037208/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:12052/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:130699/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:148850/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:203580/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:250837/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:267460/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:282195/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:366011/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:1014946/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:414537/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:442025/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:450842/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:465373/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:474234/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:47486/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:484679/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTc  <  1:487776/62‑1 (MQ=255) gcACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACAGATTc  <  1:636815/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCACCCGCGACCCACGCCACGCAATGGTGCCGGGCATCGGGGTGTTCTGCCCGCACCGATTC  >  minE/2365943‑2366004

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑