Missing coverage evidence...
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ATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCAA  >  minE/2408945‑2409006 |                                                              aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACGCGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:895885/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:805475/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:559750/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:564110/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:567993/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:600138/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:605173/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:623311/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:635600/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:635641/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:72002/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:764889/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:773561/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:779905/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:550252/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:849918/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:851135/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:853244/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:868636/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:87688/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:882043/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:901491/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:902289/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:902740/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:963027/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:966151/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:347380/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:1030653/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:1036431/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:185868/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:214570/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:218950/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:221572/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:24219/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:26092/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:263508/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:264497/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:295268/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:312416/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:1010403/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:354717/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:374690/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:380152/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:39328/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:408030/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:426216/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:465026/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:48300/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:490143/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:503398/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:511526/62‑1 (MQ=255) aTCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCaa  <  1:542536/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGCAA  >  minE/2408945‑2409006

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑