Missing coverage evidence...
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TGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAC  >  minE/214989‑215050 |                                                              tGGTGCTGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:778642/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:843989/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:59834/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:599509/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:63241/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:675915/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:6961/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:7082/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:767790/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:79752/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:839849/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:582473/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:910927/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:923362/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:927897/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:932462/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:947905/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:95409/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:976707/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:985934/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:998941/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:353819/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:137261/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:159791/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:174259/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:193674/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:256248/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:266018/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:301713/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:319830/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:321669/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:331665/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:116175/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:360700/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:370642/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:388667/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:414704/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:4332/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:483282/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:505307/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:514349/62‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAc  <  1:554161/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGGTGCCGTTGAAGTGGTGAACCGTCGCCTGACGGGCAATAACTTCCATGTTTATCTCAAAC  >  minE/214989‑215050

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑