Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2431546	2431572	27	13 [0]	[0] 26	rho	transcription termination factor

CAGCAGAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTGC  >  minE/2431573‑2431633 |                                                             cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAAt         >  1:634160/1‑54 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:430485/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:981627/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:965873/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:829142/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:822703/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:815011/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:743001/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:669442/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:662776/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:649055/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:64534/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:558483/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:1025326/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:4270/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:397974/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:390438/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:364083/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:289361/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:285374/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:277052/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:266823/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:236023/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:219146/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:208212/1‑61 (MQ=255) cagcagAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTgc  >  1:138790/1‑61 (MQ=255) |                                                             CAGCAGAACCATCAGCACACAATCCGGGTGGTTGTAAGCAATGCTCTGAGCAATGTTCTGC  >  minE/2431573‑2431633

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑