Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2443337	2443386	50	34 [0]	[0] 80	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

TTTCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTGCGC  >  minE/2443387‑2443425 |                                       tttCTGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:276519/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:619260/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:72828/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:721277/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:672091/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:663926/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:663719/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:637023/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:63313/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:624609/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:510130/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:619201/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:618978/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:617741/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:555712/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:536495/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:534898/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:532972/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:529519/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:107733/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:866157/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:943322/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:942090/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:938918/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:933962/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:930003/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:927336/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:873325/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:870796/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:867368/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:729709/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:854620/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:836010/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:82119/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:818808/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:808732/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:769498/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:750945/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:731613/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:235151/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:329282/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:108829/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:256429/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:254655/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:131383/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:251942/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:249738/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:238353/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:339036/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:224420/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:221046/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:218978/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:216655/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:203034/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:145868/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:158631/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:156588/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:417468/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:503940/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:486227/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:484462/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:476914/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:470689/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:464286/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:504701/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:423507/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:396581/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:38613/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:382032/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:379813/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:1034691/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:37317/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:362623/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcgc  >  1:351986/1‑39 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcg   >  1:987037/1‑38 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcg   >  1:169877/1‑38 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcg   >  1:756823/1‑38 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTgcg   >  1:432483/1‑38 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGACCTgcg   >  1:661585/1‑38 (MQ=255) tttCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTAGAGCGTCCTgcgc  >  1:277480/1‑39 (MQ=255) |                                       TTTCGGCGTCCAGGCTTTGTCACCTCGAGCGTCCTGCGC  >  minE/2443387‑2443425

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑