Missing coverage evidence...
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CAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTAA  >  minE/2473503‑2473563 |                                                             cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:593357/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:997661/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:981597/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:981018/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:854779/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:846477/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:808402/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:807228/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:772286/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:760302/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:757178/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:691324/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:687013/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:638325/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:1025295/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:588123/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:587833/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:519818/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:505246/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:491236/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:425528/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:395902/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:227608/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:210704/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:174038/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:125989/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTaa  >  1:122059/1‑61 (MQ=255) cAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTa   >  1:431608/1‑60 (MQ=255) |                                                             CAGCCGAACGCGATCAAAAACACCCTTACCGGACGCATCAGCCACGGTCAGGTTGATTTAA  >  minE/2473503‑2473563

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑