Missing coverage evidence...
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CCTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGAC  >  minE/2478117‑2478179 |                                                               ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGTGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:666161/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:635238/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:984747/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:875731/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:860395/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:846538/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:816523/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:810879/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:648100/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:134519/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:623181/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:599732/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:492942/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:465184/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:461329/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:230543/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:199358/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:183587/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:176524/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGAGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGa   >  1:83115/1‑62 (MQ=255) ccTGGATATCGAT‑AAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGAc  >  1:788378/1‑62 (MQ=38) |                                                               CCTGGATATCGCTAAAAACCAGGTAACGGCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGAC  >  minE/2478117‑2478179

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑