Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2479462	2479529	68	16 [0]	[0] 9	phoU	DNA‑binding transcriptional regulator

AGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATAA  >  minE/2479530‑2479591 |                                                              aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:244863/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:378303/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:505582/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:521500/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:577442/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:684175/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:850881/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATaa  >  1:977274/1‑62 (MQ=255) aGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATACaa  >  1:616815/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGCGACAAATAATTCACCAGACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTTATATATAA  >  minE/2479530‑2479591

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑