Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2495719 2495843 125 23 [0] [0] 103 emrD multidrug efflux system protein

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

GTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATC  >  minE/2495844‑2495904
|                                                            
gTTCCACATCTTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:777787/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCGAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:949646/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGCCCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:259338/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGGTTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:926943/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTATCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:580886/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGGGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:1029552/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGc                    >  1:252224/1‑43 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCTACGGACTGACGAGAATc  >  1:473556/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACg                >  1:681260/1‑47 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTg           >  1:655734/1‑52 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGaa    >  1:385292/1‑59 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:61223/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:67481/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:668761/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:663399/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:654110/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:632303/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:629723/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:628448/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:626098/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:690293/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:605730/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:601363/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:595648/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:594258/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:588024/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:587276/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:584299/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:583282/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:98650/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:864267/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:947968/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:947916/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:94163/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:935458/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:968232/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:91595/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:898850/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:984305/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:890676/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:885105/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:873311/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:686646/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:807622/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:802159/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:799696/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:777966/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:1024590/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:755326/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:754092/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:732246/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:698940/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:950403/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:23855/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:352087/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:338737/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:33634/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:336080/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:33394/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:316678/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:301802/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:301506/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:297329/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:277457/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:248510/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:353294/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:23001/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:198089/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:195781/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:172466/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:170284/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:167210/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:163010/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:156471/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:141722/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:129725/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:454941/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:577840/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:544598/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:538636/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:534330/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:531651/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:523771/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:522811/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:473788/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:462274/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:458541/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:454985/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:579775/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:447827/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:445072/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:443330/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:425882/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:424451/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:389717/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:383405/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:366722/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:360560/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTCCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:265607/1‑61 (MQ=255)
gTTCCACATCCTATCCAGCAGACCGCCGAATAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATc  >  1:367790/1‑61 (MQ=255)
|                                                            
GTTCCACATCGTATCCAGCAGACCGCCGATTAGCGGTGCGAGCAACGGACTGACGAGAATC  >  minE/2495844‑2495904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: