Missing coverage evidence...
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AAACCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGTAAGTAAG  >  minE/2511816‑2511877 |                                                              aaaCCACTCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:780902/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:598043/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:584091/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:605792/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:65324/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:68685/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:693319/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:723972/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:725526/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:740759/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:744238/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:780751/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:789432/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:901018/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:911124/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:917468/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:923183/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:931776/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:972388/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:977967/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:980746/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:357600/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:137435/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:181054/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:240995/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:254828/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:271748/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:305299/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:310345/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:333447/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:343554/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:1017267/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:365849/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:386062/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:387893/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:449480/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:468805/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:475664/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:492717/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:497246/62‑1 (MQ=255) aaaCCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGtaagtaag  <  1:55041/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAACCACGCCAGCGCATATCCGGCCGCCATCGCAATTACCAGTGAGGCCACGCGTAAGTAAG  >  minE/2511816‑2511877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑