Missing coverage evidence...
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CGCCGCGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAT  >  minE/2546631‑2546692 |                                                              cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:76591/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:465411/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:46695/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:488008/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:583054/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:654356/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:679834/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:694609/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:731375/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:752869/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:455425/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:778781/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:784572/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:841889/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:842498/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:920518/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:94450/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:951414/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:99202/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:298856/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:12094/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:146659/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:153000/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:189472/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:233387/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:233497/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:274175/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:29719/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:1006986/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:306487/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:307329/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:359382/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:36769/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:368831/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:38728/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:405618/62‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAt  <  1:435019/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCCGCGCGCAGATTTGTCAGATCTGCCTGAGTGAACGCCTGATAGCGGCCTTTCAGTTTAT  >  minE/2546631‑2546692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑