Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2587951 2587984 34 19 [0] [0] 94 mdtE multidrug resistance efflux transporter

CGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAT  >  minE/2587985‑2588046
|                                                             
cGCTTTGGCGACGGTGAGATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:979291/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGGGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:521824/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCTTAAt  <  1:545021/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:76904/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:780886/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:761826/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:741078/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:735005/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:734591/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:727000/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:710121/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:698016/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:689888/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:687418/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:680840/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:642331/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:594757/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:586609/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:582315/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:57255/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:571504/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:567905/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:555991/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:548646/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:88328/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:1030244/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:994927/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:990904/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:962482/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:954243/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:947695/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:925338/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:911596/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:910698/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:897646/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:889132/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:774692/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:877738/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:871986/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:869750/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:851783/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:848510/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:836778/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:816149/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:791586/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:784110/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:998108/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:273895/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:543016/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:35566/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:355311/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:354208/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:34504/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:34308/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:330668/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:326214/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:31846/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:305976/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:279709/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:361472/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:252585/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:241565/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:231117/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:194768/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:189425/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:167109/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:161666/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:161055/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:160295/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:1033465/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:459529/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:541411/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:505215/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:500665/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:499442/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:495723/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:476022/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:474898/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:467458/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:46610/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:465570/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:361570/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:455689/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:449317/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:429625/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:421058/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:414840/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:373022/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:369530/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:36784/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGGGTCGTAAt  <  1:889457/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGCGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:977528/62‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTAATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:438757/62‑1 (MQ=255)
cGCCTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAt  <  1:448299/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
CGCTTTGGCGACGGTGACATTGGCTTCTGCTTCATTCAACTGGGTGCGCGCGGTGTCGTAAT  >  minE/2587985‑2588046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: