Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2590778	2591261	484	12 [0]	[0] 33	[hdeA]	[hdeA]

AAAATTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAC  >  minE/2591262‑2591323 |                                                              aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:686708/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:521953/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:522355/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:533250/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:550128/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:56888/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:579425/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:595682/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:649716/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:498653/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:720906/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:75704/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:893804/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:91820/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:925448/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:967230/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:984225/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:129032/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:442972/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:44011/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:408479/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:406224/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:400262/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:39956/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:384750/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:370102/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:350764/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:336125/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:278472/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:258185/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:25462/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:216133/62‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAc  <  1:210237/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAAATTAAGAAAGATATGTAATTCCGGGAATGCGTTACATCGTACTTCCTTGCATATTGAAC  >  minE/2591262‑2591323

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑