Missing coverage evidence...
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GTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGAAG  >  minE/2637478‑2637540 |                                                               gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGAt                >  1:327776/1‑49 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTg     >  1:622726/1‑60 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:764190/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:655176/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:661815/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:671960/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:680377/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:747102/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:747840/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:757682/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:612496/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:796981/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:830796/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:839113/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:893747/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:923724/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:936841/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:955644/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:986387/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:995010/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:100893/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:124632/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:131743/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:169609/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:245020/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:281177/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:286502/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:286556/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:355610/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:37985/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:483846/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:519460/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:57340/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:593695/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:613630/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACACTGATGCTGCCGGTTGa    >  1:371814/1‑61 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCATCTGGATCATTTTTATCAccca                   >  1:1017405/1‑45 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACC‑CTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGAAg  >  1:188207/1‑62 (MQ=255) gTTTTCCGCTACGTAACATCTTCTTCTGGATGATTTTTa                          >  1:232491/1‑39 (MQ=255) |                                                               GTTTTCCGCTACGTAACCTCTTCTTCTGGATGATTTTTATCACCCTGATGCTGCCGGTTGAAG  >  minE/2637478‑2637540

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑