Missing coverage evidence...
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AATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCT  >  minE/2665334‑2665385 |                                                    aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCAc             >  1:584146/1‑41 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTc   >  1:389998/1‑51 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:776179/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:576291/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:576526/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:636438/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:653390/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:680721/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:731021/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:527532/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:789450/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:890287/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:906091/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:919438/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:937454/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:941896/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:952820/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:139915/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:469875/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:463831/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:461913/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:389254/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:377835/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:373337/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:360656/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:332231/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:313810/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:299487/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:28778/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:196096/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:193706/1‑52 (MQ=255) aaTTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCt  >  1:141505/1‑52 (MQ=255) |                                                    AATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCT  >  minE/2665334‑2665385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑