Missing coverage evidence...
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CCCATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAC  >  minE/2678735‑2678796 |                                                              cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:785112/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:571907/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:586619/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:586978/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:596107/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:606223/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:637188/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:69309/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:746090/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:758228/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:778686/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:570312/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:799000/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:922173/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:92923/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:93361/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:944272/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:94617/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:956239/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:958936/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:985586/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:999548/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:369468/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:134240/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:152766/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:188268/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:202582/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:204497/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:271465/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:328627/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:339723/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:347208/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:355683/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:1029874/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:378508/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:381608/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:390104/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:410665/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:415546/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:423342/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:44552/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:454990/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:55325/62‑1 (MQ=255) cccATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAc  <  1:563956/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCATCGCCCCGGTACCCATTTCGCCGTCGCCTTTGCTGGCTTCAATGGGGTTCATCAGTAC  >  minE/2678735‑2678796

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑