Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2715797	2715968	172	68 [0]	[0] 63	[tsgA]	[tsgA]

ATATTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTC  >  minE/2715969‑2716011 |                                           atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGcc        >  1:391025/1‑37 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCt       >  1:1032400/1‑38 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGtt   >  1:9962/1‑42 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGtt   >  1:203310/1‑42 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGtt   >  1:978516/1‑42 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:401608/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:479682/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:545783/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:584970/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:636475/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:471981/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:63922/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:661763/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:665053/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:715747/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:766704/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:775698/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:78558/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:787918/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:811982/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:826222/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:845249/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:846259/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:848752/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:884186/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:912608/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:917326/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:938383/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:939656/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:962257/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:972432/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:973456/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:977533/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:251178/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:120293/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:132533/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:154428/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:159601/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:169032/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:172218/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:177837/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:209522/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:214866/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:227960/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:233722/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:241124/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:247436/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:247552/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:468260/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:260878/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:262729/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:275618/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:281965/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:316693/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:318927/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:321597/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:327162/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:339139/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:355995/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:36000/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:379998/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:1006039/1‑43 (MQ=255) atatTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTc  >  1:106571/1‑43 (MQ=255) |                                           ATATTTCAGATACGTAAAATTAGGTAAAGGGATGGCCTTGTTC  >  minE/2715969‑2716011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑