Missing coverage evidence...
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AATCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAT  >  minE/2716081‑2716141 |                                                             aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCgctctttctgct                   >  1:274646/1‑44 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCgcagca    >  1:549019/1‑59 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCgcag      >  1:194666/1‑57 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCaa   >  1:848991/1‑60 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:792932/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:498356/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:534217/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:537596/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:537772/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:551942/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:559852/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:572733/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:583956/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:645315/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:706708/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:769084/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:494133/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:825222/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:863631/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:892919/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:921854/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:929493/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:970761/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:981158/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:990430/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:289641/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:166323/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:192242/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:206536/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:210482/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:212013/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:225236/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:228462/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:238446/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:276299/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:285978/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:1000939/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:309280/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:320168/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:36744/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:372139/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:38052/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:381262/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:393274/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:467513/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:479693/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:481276/1‑61 (MQ=255) aaTCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTATCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAt  >  1:574726/1‑61 (MQ=255) aaTAGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTtctc            >  1:977091/1‑51 (MQ=255) |                                                             AATCGACCCTGGCGGCGATGGCTGCTGTTTTCGCTCTTTCTGCTCTTTCTCCCGCAGCAAT  >  minE/2716081‑2716141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑