Missing coverage evidence...
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TGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCGTGG  >  minE/2741251‑2741304 |                                                      tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:552799/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:658520/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:658102/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:634099/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:631281/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:627876/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:621519/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:606329/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:590202/54‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATATGCTGCGCGTTCTGGGTAAAGCAGGTGCTGCACGCTGGCgtgg  <  1:659540/54‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑